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成立於96年的東沙環礁國家公園，是台灣第一座海洋型的國家公園，最大的特色是美麗的環礁地形及豐富的珊瑚礁生態資源，但是鳥兒們也是東沙島的耀眼明星。至目前為止，東沙島總共已記錄到231種鳥類，這個數目可是全台灣鳥類總數560種的1/3喔！以東沙島面積僅有1.74平方公里，還不到台灣土地面積的2萬分之1，在如此小的陸域面積上擁有如此多的鳥種數目，東沙島的鳥種密度無疑是全台最高的。
東沙島雖然面積小，但正好位於東亞候鳥遷移路線的中間位置，且同時擁有樹林、沙灘、潟湖等棲息環境與覓食場所，對南來北往的候鳥們來說，東沙島是一個極佳的中途休憩站。海洋國家公園管理處為瞭解東沙島的鳥類生態，委託高雄市野鳥學會於2008～2009年持續密集的調查，在兩年期間，將東沙島的鳥種數目推到231種之多，其中輝椋鳥（Aplonis panayensis）、短嘴金絲燕（Aerodramus brevirostris）及烏鵑（Sunniculus lugubris）等3種尚未被列入台灣的野鳥名錄中。
東沙島的鳥類以候鳥為主要組成，有種類多、季節變化大而族群量少的特點。在春秋候鳥遷移的季節，過境東沙島的候鳥非常多，種類也非常豐富，灰面鷲、赤腹鷹、紅尾伯勞、黃頭鷺、燕鴴、黃鶺鴒、樹鷚、家燕等，密度和數量非常高，而翻石鷸的數量是最多且幾乎全年可見。但最令人意外的是，在2009年11月居然也發現到兩隻黑面琵鷺，並且停留了3天！
另外有幾種是台灣不易發現的稀有鳥種，例如軍艦鳥、紅胸鴴、小桑鳲、小椋鳥、北椋鳥、半蹼鷸、噪鵑、花雀、池鷺、黑腹燕鷗、冠郭公等，數量雖然都不是很多，但在東沙島可不難發現它們的蹤跡。
另外在2008年及2009年的調查期間所繫放的紅胸濱鷸在澳洲達爾文市被記錄到；前一年繫放的翻石鷸、紅胸濱鷸和磯鷸也會再回到東沙島；在調查過程中也發現到來自大陸崇明島、澳洲南部、澳洲東南部、澳洲西北部和紐西蘭北島的三趾鷸、翻石鷸、鐵嘴鴴、紅胸濱鷸和黃足鷸等；顯示東沙島在東亞-澳洲候鳥遷徙路線上，扮演重要之中途歇息點之地位。
東沙島曾是海鳥聚集、繁衍的地方，但因人類的開發行為破壞了原來的植被，導致東沙島目前除了白腹秧雞外未能有任何的留鳥族群。海洋國家公園管理處目前正致力於東沙島原生植被復育的工作，除了回復東沙島的自然風貌外，亦能營造出更多樣的鳥類棲息環境，將使東沙島成為鳥類的海上樂園。
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